土壤DNA提取试剂盒的比较
Mpbio公司的FastDNA® Spin Kit for Soil是全世界公认的土壤基因组DNA提取的“黄金品牌”，可高效裂解土壤中的所有生物包括G+ 细菌、酵母菌、真菌、藻类、线虫甚至真细菌的孢子、芽孢，从而获得高产的基因组DNA。另外它已成功应用于其他环境样品中的DNA提取，如海洋沉积物、排泄物、废水、雪水等。您只需用500mg的样品开始实验，在30min-60min内即可得到足够的纯化DNA用于PCR、限制性酶切、电泳及其他下游实验。
² 应用广泛：适用于不同类型土壤（如粘土、沃土、陶土、沙质土）及其他环境样品（如海洋沉积物、
废水、雪水、排泄物）中基因组DNA的提取；
² 不受腐殖质干扰：同样适用于含高腐殖酸的土壤，只需配制简单的硫氰酸胍，稍改protocol，即可
得高产高纯目的基因组DNA；
² 灵活应用、快速高效：可配合FastPrep®仪器使用，40s裂解细胞，30min完成基因组DNA提取；亦
可配合漩涡混匀器或震荡仪使用，60min内即可获得足够量的基因组DNA；
² 纯度高：基于硅吸附DNA原理的GENECLEAN®纯化柱，保证基因组DNA的高纯度，并直接用于PCR扩增、
电泳、酶切及其他下游实验；
无毒无害：不含有毒有害的试剂成分。
如果您第一次开始土壤微生物多样性研究，请用FastDNA® Spin Kit for Soil，几千篇文献的技术支持，绝不让您失望；
如果您为样品珍贵且样品中基因组量 而烦恼，请用FastDNA® Spin Kit for Soil，高效、高重复性是对您的信任的最佳回报；
如果您是Epicentre试剂盒的使用者，请用FastDNA® Spin Kit for Soil，无论多脏、多复杂的土壤，都能完美应付；
如果您是Mo Bio试剂盒的使用者，请用FastDNA® Spin Kit for Soil，您会发现没有最好，只有更好；
那让我们来看看Mpbio的FastDNA® Spin Kit for Soil好在哪里？
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Mpbio 与Mo Bio土壤基因组DNA提取试剂盒产品比较 |
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产品描述 |
FASTDNA® SPIN KIT FOR SOIL（品牌：Mpbio，Cat#：6560200，以下简写FastDNA® ）
UltraClean® Soil DNA Isolation Kit （品牌：Mo Bio，Cat#：12800，以下简写UltraClean®） |
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Qustion 1：
试剂盒的工作原理 |
Response 1：两个试剂盒都是由两部分组成，一部分是样品处理阶段，重在细胞裂解效果；第二部分就是DNA纯化，重在纯化和回收效率。试剂盒内的组成成分目的和功能差不多相同，但在处理效果上会差异。 |
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FastDNA®：
Lysing Matrix E tube （含裂解基质裂解细胞）
Sodium Phosphate Buffer，MT Buffer（防核酸降解，溶解核酸和蛋白。确保DNA尽量免受RNA污染）
PPS Solution（蛋白沉淀溶液，去除蛋白污染）
Binding Matrix （DNA结合溶液，促进DNA与硅胶结合）
SPIN Modules，Catch Tubes 基于硅石的Geneclean离心纯化柱，确保DNA的快速洗脱、高纯度）
Concentrated SEWS-M（溶解和清洗DNA）
DES （无DNase、热原质水，确保DNA无降解及无外来热原质污染）
BBS Gel Loading Dye（基因组DNA上样缓冲液） |
UltraClean®：
Bead Solution Tubes（含裂解基质裂解细胞）
Solution S1（含SDS，辅助分解膜上的脂肪酸和脂质）
IRS Solution（用于沉淀腐植酸和其他PCR抑制因子）
Solution S2（含蛋白沉淀试剂，去除蛋白污染）
Solution S3（DNA结合盐溶液）
Solution S4（清洗DNA，除盐、腐植酸或其他残留污物）
Solution S5（溶解DNA并促离心洗脱）
Spin Filter Units in 2 ml Tubes，2 ml Collection Tubes
（基于硅膜的离心纯化柱） |
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Qustion 2：
可处理样本？ |
Response 2：两个试剂盒的应用范围都很广，可用于各种土样或粪便中的基因组DNA提取。但FastDNA®相对更广，它已经成功应用于海底沉积物、废水、雪水等环境样品中基因组DNA的提取。
可见参考文献：
Snow sample —Takahiro Segawa et al. (2005). Appl. Envir. Microbiol., Vol 71: 123 - 130.
Sediment —Tracy J. Mincer et al. (2005). Appl. Envir. Microbiol., Vol 71: 7019 - 7028. |
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Qustion 3：
细胞裂解方式及配合使用仪器？ |
Response 3：两个试剂盒裂解细胞的方式有所差异，这很大程度影响了基因组DNA提取量及片段的完整性。 |
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FastDNA®：
（1）裂解介质是含3种尺寸的颗粒：1.4 mm陶瓷，0.1 mm的硅颗粒，4 mm的玻璃珠混合物，可控的基质颗粒尺寸和数量，保证实验的可重复性；且不同尺寸保证样品的充分接触及受力；
（2）配合FastPrep instrument（Mpbio专有仪器）使用，“8字型”运动方式使得样品40 s内即可得到充分裂解；更换适配器，可同时处理1—96个样品。
（3）配合漩涡混匀器或震荡仪，借助于振动和涡旋式冲击的混合力裂解细胞，一般作用2～5 min可充分裂解；可同时处理多个样品。处理方式相对FastPrep仪器温和，DNA的完整性相对高些。 |
UltraClean®：
（1）裂解基质是单一玻璃珠；
（2）配合漩涡混匀器使用，借助于涡旋式冲击和振动裂解细胞，处理方式相对温和。更换特定的适配器，可同时处理1-96个样品。样品一般要处理10min左右，相对轻柔的作用力，可得到较大分子量的DNA，但裂解效果相对差于FastDNA®。 |
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Qustion 4：
DNA提取含量及完整性？ |
Response 4： FastDNA®提取的基因组DNA效率高于UltraClean®，一般同一样品浓度高3-5倍左右；
参考文献：fecal specimens — Merlin W Ariefdjohan et al. (2010).Nutrition Journal., Vol 9: 23
Sediment — Gordon Webster et al. (2003). Journal of Microbiological Methods 55:155-164.
FastDNA®配合FastPrep仪器使用DNA的完整性会相对差于UltraClean®。前者的DNA片段为4-20kb，后者的DNA片段最高达50kb。若不与FastPrep仪器配合使用，DNA的完整性会明显得到提高，DNA提取率仍高于UltraClean®。 |
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Qustion 5：
是否适合高腐殖质样品的处理？ |
Response 5：两个试剂盒都有针对高腐殖土样的特殊处理试剂，从而确保基因组DNA提取不受困扰。（因为腐殖质是土样中普遍存在的成分，也是干扰DNA和RNA提起的重要因素之一）。 |
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FastDNA®针对高腐殖质的土样会提供一个特殊的protocol。只需多配制5.5M硫氰酸胍溶液即可保证DNA的高提取效率。 |
UltraClean®含有IRS Solution（Mobio专利技术）用来沉淀腐殖酸和一些PCR干扰因子。 |
